大徳寺如意庵の元住職、立花大亀師が昭和55年大宇陀町（現：宇陀市大宇陀）に松源院（元大徳寺塔頭（たっちゅう＝別院*）を再興しました。
そのとき、同師が所持する墨蹟、茶道具などの美術品 および民具などを永久保存するとともに、広く一般に公開して美術品の鑑賞・学術研究の資とし、文化の振興に寄与することを願って（財）松源院民芸館を設立しました。同師の遷化（平成17年）ののち、地区民の教化、県指定文化財山岡庄屋の保存（松源院の復興）、清泉庵の開創（＝寺を開くこと*）などの地域への（同師の）貢献を記念するため、本館の名称を「大亀和尚民芸館」に改めました。(当財団法人の寄付行為に関する文書から抜粋）
歴史的建造物であるにもかかわらず、門は閉ざされ拝観謝絶の札が掛かったまま。